در اجرای مفاد تبصره (1) بند (الف) ماده (9) قانون مالیات بر ارزش افزوده مصوب 1400 مبنی بر”واردات کالاهای موضوع جزء‌های (1)، (3) و (5) بند (الف) مشمول معافیت نبوده و مالیات و عوارض با نرخ استاندارد 9 درصد در مبادی گمرکی به آن تعلق می‌گیرد. عرضه این کالاها در داخل کشور، مانند عرضه کالاهای مشابه داخلی از پرداخت مالیات و عوارض معاف است”. عرضه داخلی برنج، معاف از مالیات و عوارض ارزش افزوده بوده، لیکن واردات آن مشمول پرداخت مالیات و عوارض ارزش افزوده در مبادی گمرکی می‌باشد.

به‌موجب حکم جزء (2) بند (الف) تبصره (9) قانون بودجه سال 1403 کل کشور «به‌منظور حمایت از تولیدکنندگان و مصرف کنندگان به دولت اجازه داده می‌شود حقوق گمرکی و مالیات ارزش افزوده واردات کالاهای اساسی، دارو و مواد اولیه دارو، نهاده‌های دامی و کشاورزی، ملزومات مصرفی پزشکی و شیرخشک مخصوص اطفال را به یک درصد (۱%) کاهش دهد. مواردی که کمتر از یک درصد (۱%) است به‌همان میزان کمتر، باقی خواهد ماند». بر این اساس، به‌موجب تصویب نامه شماره 12849/ت62504 مورخ 1403/01/29 هیات محترم وزیران (موضوع بخشنامه شماره 210/7665/د مورخ 1403/03/11) و اصلاحیه‌های آن به شماره‌ 85614/ت 62645 هـ مورخ 1403/06/04 و شماره 14523/ت 63446 مورخ 1403/09/20، حقوق گمركي و ماليات بر ارزش افزوده واردات كالاهاي اساسي (گندم، برنج، شكر خام، روغن خام، دانه هاي روغني، ذرت، كنجاله سويا، جو، حبوبات (نخود، لوبيا و عدس)، گوشت قرمز و گوشت مرغ) به تعداد (57) رديف تعرفه، به شرح جدول شماره (1) پيوست تصويب‌نامه كه تأييد شده به مهر هيئت دولت است، به ميزان يك درصد (1 %) تعيين شده است. لیکن وفق جزء (1) بند (ذ) تبصره یک قانون بودجه سال ۱۴۰۴ کل کشور مبنی بر «در سال ۱۴۰۴ حقوق گمرکی واردات دارو و مواد اولیه آن، ملزومات مصرفی پزشکی، شیرخشک مخصوص اطفال و مواد اولیه آن، کالاهای اساسی، نهاده‌های دامی و کشاورزی را به یک درصد (۱%) کاهش دهد. سایر اقلام و کالاهایی که حقوق گمرکی آنها به موجب قوانین و مقررات مربوط زیر یک درصد (۱%) می‌باشند به قوت خود باقی است» لذا با عنایت‌به قسمت اخیر ماده 6 قانون مالیات‌برارزش‌افزوده، با عنایت به اینکه عبارت مالیات ارزش افزوده در متن جزء مذکور تصریح نشده، بنابراین کاهش نرخ حقوق ورودی در این جزء قابل تسری به نرخ مالیات بر ارزش افزوده واردات کالاهای یاد شده نخواهد بود.

لازم به‌ذکر است لایحه دو فوریتی اصلاح جزء (1) بند (ذ) تبصره یک قانون بودجه سال ۱۴۰۴ کل کشور در جلسه علنی مجلس شورای اسلامی به تاریخ 1404/02/07 بررسی و به‌تصویب نمایندگان رسیده است که پس از طی مراحل قانونی ابلاغ و اجرا خواهد شد.